本期客戶訪談我們邀請到了動物健康實驗室的Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu，他們將為我們分享他們使用Opentrons OT-2自動化移液平臺進行包括MALDI-TOF MS目標制備在內(nèi)的質(zhì)譜應(yīng)用。

Anatoliy Trokhymchuk?是?Prairie Diagnostic Services Inc. (PDS) 的首席科學(xué)家，該公司是薩斯喀徹溫大學(xué) 附屬的地區(qū)動物健康實驗室。?Mengying Liu?是 PDS 處理流程改進和自動化工作流程開發(fā)的自動化研究員。她的自動化開發(fā)案例之一就是使用 Opentrons OT-2 自動化移液平臺進行質(zhì)譜應(yīng)用，包括MALDI-TOF MS目標制備。

Opentrons: 請介紹一下您的研究背景。

Mengying Liu: 我是 PDS 的研究助理。我在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)獲得了獸醫(yī)博士學(xué)位，然后來到薩斯喀徹溫大學(xué)攻讀獸醫(yī)病理學(xué)碩士學(xué)位。我在一月底開始為 PDS 工作。我對計算機編程很感興趣，并將其與實驗室檢測相結(jié)合，我很享受在 PDS 學(xué)習的時光。

Opentrons: 你們的研究項目是什么？

Anatoliy Trokhymchuk:?我是一名獸醫(yī)，為一家地區(qū)性獸醫(yī)診斷實驗室工作，我日常工作需要與各種客戶和項目打交道。有些項目，如監(jiān)測測試和疫情應(yīng)對，需要進行大規(guī)模的檢測工作。我們在 PDS 有一群優(yōu)秀的人才，我的工作是激勵他們，并為他們提供工作必備工具的必要支撐。

Opentrons: 為什么您會選擇OT-2？

Anatoliy Trokhymchuk: 隨著我們工作量的增加和診斷方法的日益改變，我們需要在實驗室完成更多、更精確的常規(guī)、重復(fù)性任務(wù)，我們逐漸意識到自動化才是實驗室未來的趨勢。我們實驗室已經(jīng)有了很多不同類型的機器人，我們也正在快速學(xué)習如何使用 OT-2。在不久的將來，我們將會有更多基于基因組的快速診斷工作，而自動化是完成這些工作的重要組成部分。

我認為人類在實驗室的主要目標是探索科學(xué)的邊界，并不斷嘗試科學(xué)創(chuàng)新。– Mengying Liu

Opentrons: 你們使用OT-2做了哪些項目，它如何適應(yīng)你們的工作流程？

Anatoliy Trokhymchuk:?目前 OT-2 在我們實驗室有兩個主要用處：一項是用于運行 Mengying 正在使用的自動化流程，另一項是作學(xué)習工具。我們正在學(xué)習如何優(yōu)化協(xié)議和提高工作產(chǎn)出，以此擴大我們的業(yè)務(wù)。作為一個科研工具而言，我們非常喜歡 OT-2，但我們更它賦予的更大的探索價值：如何將更大的任務(wù)進行自動化并將其集成到我們的工作流程中？

Opentrons: 在實驗室里，您的日常工作是怎樣的？您會使用到哪些檢測方法？

Mengying Liu: 我的日常工作是致力于不同實驗室檢測的自動化流程開發(fā)和運行，例如 MALDI 靶涂層。我們的系統(tǒng)使用一個與制造商無關(guān)的 96 點靶。我在我們實驗室使用 OT-2 自動化移液平臺創(chuàng)建了一個工作流程和協(xié)議。

在我們擁有 OT-2 之前，我們的操作員需要手動將基質(zhì)滴加到 96 個孔中，做這個步驟時細菌樣本已經(jīng)取樣到靶上了，這項工作其實很容易被機器人取代。此外，因為我們是診斷實驗室，我們必須確保沒有樣本污染，所以操作員每次操作都需要更換吸頭。OT-2 可以精確地處理到 0.1 mm 的移液，使我們能夠不接觸樣品就滴加基質(zhì)——我們整個靶只需要用到 8 個移液吸頭，減少了塑料廢物。

實驗室不是一個整天在移液工作上浪費時間的地方，實驗工作需要富有成效和創(chuàng)造力。 – Anatoliy Trokhymchuk

此外，我們設(shè)計的協(xié)議很容易設(shè)置。這就是我們使用 OT-2 的原因：技術(shù)嫻熟的技術(shù)人員可以在 5 分鐘內(nèi)手動執(zhí)行整套工作流程，OT-2也可以大致以同樣的速度完成。但是 OT-2 的優(yōu)勢是不需要高度熟練的技術(shù)人員也可以執(zhí)行同樣的流程，這讓技術(shù)人員可以騰出時間去做其他事情。我們正在努力在整個實驗室標準化這一點。

我通過使用 Opentrons API 和自定義界面將 OT-2 鏈接到我們的 LIMS 系統(tǒng)以生成顯示對照品和樣品的板圖，我可以將其導(dǎo)出為純文本文件并上傳為我的協(xié)議。這節(jié)省了很多時間，并且可以很方便地與實驗室的其他工具集成。OT-2 使用起來很容易，因為我只需要在開始時校準機器人一次，每次可以執(zhí)行多達 8 個板。我正在探索 OT-2 的其他應(yīng)用，讓它可以更輕松地投入到其他實驗室的工作中。

OT-2 具有不同的集成潛力，因此當完成 MALDI 工作流程時，我會用它執(zhí)行其他工作流程。

Opentrons: 在疫情之前，您的常規(guī)日常工作是什么？

Anatoliy Trokhymchuk:?我們現(xiàn)在在做的日常工作與疫情之前完全相同。然而，在疫情期間，我們需要在實驗室戴口罩，并遵循公共衛(wèi)生部門規(guī)定的所有預(yù)防措施。我們認為我們的服務(wù)是必不可少的，盡管我們不知道這里的疫情會發(fā)展到什么程度，也不知道我們的實驗室是否會被要求提供檢測支持，但我們的職能和工作沒有改變。我們沒有直接參與疫情應(yīng)對，但我們在加拿大魁北克省地區(qū)的同行們將他們的動物衛(wèi)生實驗室用于新冠病毒檢測。

Opentrons: 您有其他自動化項目的計劃嗎？

Anatoliy Trokhymchuk:?我希望看到我們實驗室的所有自動化工具能夠無縫地協(xié)同工作，然后我可以將很多常規(guī)的實驗室任務(wù)交給機器人去執(zhí)行，而我們技術(shù)人員則負責過程監(jiān)督、控制和開發(fā)應(yīng)用程序。實驗室不是一個整天在移液工作上浪費時間的地方，實驗工作需要富有成效和創(chuàng)造力。

Mengying Liu:?那也是我衷心期望希望看到的未來！我相信有一天所有這些重復(fù)性的工作都將被自動化取代。我認為人類在實驗室的主要目標是探索科學(xué)的邊界，并不斷嘗試科學(xué)創(chuàng)新。不是把時間消耗在重復(fù)性的工作，而是做更多實驗創(chuàng)新等項目。

Opentrons: 關(guān)于OT-2的使用體驗，您還有什么想分享給大家的？

Anatoliy Trokhymchuk:?關(guān)于實驗的工作流程設(shè)計，我們需要學(xué)習的地方還有很多，不僅僅是自動化。這是一個循序漸進的過程。我們正在逐步學(xué)習，并且優(yōu)先攻克主要項目。最終，將整個工作流程交給機器人平臺是一個很好的想法，但我認為我們還離得很遠。盡管如此，由于 Opentrons 獨特的靈活性和開源特質(zhì)，為我們提供了往全流程自動化邁進的機會。

Mengying Liu:?我真的很喜歡 OT-2 的靈活性。有些公司只設(shè)計用于 MALDI 的機器，但我們在 OT-2 上可以做很多不同的協(xié)議。